Исследователи MIT и компании Cellarity создали глубокую нейросеть, которая анализирует влияние тысяч химических соединений на активность генов в десятках типов клеток одновременно
Модель показала результативность в 17 раз выше стандартного скрининга при поиске молекул для лечения болезней крови
Эффективность удваивается при добавлении результатов новых экспериментов — система учится и совершенствуется в реальном времени
Почему это меняет всё в биотехнологиях
На протяжении десятилетий фармакологи шли одним путём: берут библиотеку химических соединений — сотни тысяч молекул — и начинают тестировать каждую на выращенных в лаборатории клетках. Это работает, но медленно. Чтобы найти даже одно перспективное вещество, нужны месяцы или годы дорогостоящих экспериментов.
Проблема в том, что традиционный скрининг — это фактически перебор. Учёные случайно выбирают соединения из библиотеки и проверяют, сработают ли они. Как ловля рыбы в темноте с завязанными глазами.
Как это работает: технология позади революции
Алекс Шалек, биомедицинский инженер из MIT, и его команда обучили глубокую нейросеть DrugReflector на открытых данных о воздействии почти 9600 химических соединений на активность генов в более чем 50 типах клеток.
Это означает, что модель изучила паттерны: какие молекулы активируют определённые гены, какие их подавляют, как возникают каскадные эффекты внутри клеток. Машинное обучение позволяет ей выявлять связи, которые человеческий глаз никогда не заметит.
Затем исследователи испытали гипотезу DrugReflector на практике. Они просили модель: «Найди все молекулы, которые способны влиять на образование тромбоцитов и эритроцитов (красных кровяных клеток)». Важность этого в том, что способность управлять производством клеток крови открывает двери для терапии различных гемопатий — болезней крови.
Model предложила 107 кандидатов. Учёные протестировали их в лабораторных условиях. Результат: DrugReflector показала 17-кратное преимущество перед случайным отбором. Вместо того чтобы проверить сотни молекул, система сразу указала на самые перспективные.
Бизнес-импликации: что это значит для индустрии
1. Ускорение разработки лекарств — вместо 5–10 лет до первого испытания на человеке, компании смогут сократить это до 2–3 лет, сфокусировав усилия только на самых перспективных молекулах.
2. Снижение стоимости разработки — традиционная разработка одного препарата стоит $2,6 млрд и требует проверки десятков тысяч соединений. DrugReflector позволит работать с меньшим числом претендентов без ущерба качеству.
3. Переход от случайности к точности — вместо надежды на удачу, фарма компании получают математически обоснованные рекомендации. Это особенно критично для редких заболеваний, где традиционный скрининг экономически нецелесообразен.
4. Доступ к новым мишеням — модель способна предсказать, как молекула повлияет на сложные сетевые эффекты в клетке. Это открывает возможность лечить болезни, которые до сих пор считались неподдающимися фармакологическому воздействию.
Горизонты развития: что наблюдать в ближайшие годы
Оптимистичный сценарий (1–2 года): крупные фармакологические компании интегрируют подобные модели в рутинный процесс скрининга. Первые препараты, найденные с помощью AI, войдут в клинические испытания. Специалисты отрасли признают AI как стандартный инструмент.
Реалистичный сценарий (2–3 года): появляются гибридные подходы — AI + экспериментальные системы высокой пропускной способности работают синхронно. Компании, внедрившие эту технологию первыми, получат конкурентное преимущество. Стартапы Cellarity-типа переходят на выход (IPO или M&A).
Пессимистичный сценарий (3–5 лет): технология работает только для определённого класса болезней и молекул. Неудачи в клинических испытаниях препаратов, найденных AI, замедляют адаптацию. Требуется разработка более продвинутых моделей, учитывающих индивидуальные особенности пациентов.
Дополнительно:
Статья в Science (23 октября 2025): DrugReflector демонстрирует, как наука переходит от поиска методом подбора к методу машинного обучения. MIT и Cellarity подтверждают: будущее фармацевтики — это партнёрство между биологией и AI.
Отслеживайте: клинические испытания препаратов, найденных AI-методом; интеграция DrugReflector в системы Merck, Novartis, GSK; появление open-source аналогов из академических институтов.
Источники информации
Материал подготовлен на основе научной публикации в журнале Science (23 октября 2025), пресс-релиза MIT, официальных материалов Cellarity Inc. и анализа Nature. Данные актуальны на 26 октября 2025 г. Цитированное исследование: Shalek A.K. et al., DrugReflector: Deep-learning model for drug discovery screening based on gene activity perturbations, Science, 2025.